En hel retsdag ved Sø- og Handelsretten varer i almindelighed fra kl. 10 til kl. 16. Til frokostpause afsættes 45 minutter.
Hovedforhandlinger afholdes i rettens retssal A eller retssal B, Bredgade 70, 1. sal, eller i retssal C, Bredgade 66, 1. sal.
Såfremt retten finder det hensigtsmæssigt, har retten mulighed for at bestemme, at hovedforhandlingen afholdes et andet sted i Danmark, f.eks. ved Retten i Viborg, såfremt parter, vidner og advokater kommer fra Nordjylland.